На базе ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора работают несколько подразделений:
Научно – производственная лаборатория молекулярной диагностики инфекционных заболеваний человека и животных: основными направлениями работы лаборатории стали разработка и производство иммунобиологических препаратов (ПЦР-тест-систем) для диагностики инфекционных заболеваний, а также использование широкого спектра лабораторных исследований для клинико-диагностических целей (ДНК/РНК-диагностика методом ПЦР, иммуноферментные, биохимические, иммунологические, гематологические методы и др.). На базе лаборатории создан Отдел молекулярной диагностики и эпидемиологии ("CMD-Центр молекулярной диагностики") . "CMD-Центр молекулярной диагностики" является крупнейшей лабораторией России. Широкий спектр лабораторно-диагностических услуг, выполняемых в CMD, включает диагностику инфекционных возбудителей (ВИЧ, сифилис, вирусные гепатиты, хламидия, микоплазма, уреаплазма, гонорея и др.) с использованием различных методов исследования: ПЦР, NASBA, серологических, бактериологических, микроскопических, а также общеклинических, биохимических, иммунологических, аллергологических и многих других видов исследований.
Приоритетным направлением в диагностике инфекционных заболеваний является метод полимеразной цепной реакции (ПЦР или PCR), который позволяет выявлять инфекционные агенты, даже если они присутствуют в биологическом материале в небольшом количестве. Поэтому с помощью ПЦР возможно определять "скрытые" инфекции (такие как хламидиоз, микоплазмоз, уреаплазмоз, а также выявлять возбудителей на ранних стадиях заболевания (ВИЧ, гепатит, сифилис и др.)
Все исследования выполняются специалистами высшей категории с использованием высокопроизводительных автоматических анализаторов последнего поколения ведущих фирм США, Италии, Швейцарии и др., работающих на первичных штрихкодированных пробирках, обладающих встроенной системой контроля качества и широкими возможностями интеграции с лабораторной информационной системой. Все это позволяет обеспечивать качество лабораторной диагностики на уровне современных мировых стандартов.
Научно-консультативный клинико-диагностический центр, где пациентам оказывают высококвалифицированную медицинскую помощь. Прием ведут доктора и кандидаты медицинских наук, врачи высшей категории.
В центре можно выполнить: Исследование функций внешнего дыхания (ФВД) Ультразвуковое исследование внутренних органов (УЗИ) Электрокардиографическое исследование (ЭКГ) Скарификационные аллергологические тесты Эластографию печени (Фиброскан). Проводится вакцинация импортными вакцинами против: вирусных гепатитов (А и В), краснухи, полиомиелита, эпидемического паротита, кори, столбняка, коклюша, дифтерии, папилломавирусной инфекции.