Акустический институт является лидером в области исследований распространения звука в океане, анализа океанических шумов различного происхождения.
Ученые Акустического института внесли значительный вклад в создание и совершенствование гидроакустической техники различного назначения. Ими разработана фундаментальная теория волноводного распространения звука в океане и сделаны экспериментально подтвержденные открытия сверхдальнего распространения звука в подводном звуковом канале, дальних зон акустической освещенности и фокусировки звука. Эти открытия кардинально изменили общефизические представления о структуре звуковых полей в океане и явились основополагающими для разработки гидроакустической техники. Значение этих открытий не утратило своей актуальности и до настоящего времени.
В институте создаются современные компьютерные модели акустических полей. Развиваются методы и средства акустического мониторинга акваторий в интересах диагностики и контроля их экологического состояния и прогнозирования аномальных геофизических и геологических явлений. В 90-е годы получили дальнейшее развитие исследования методов излучения и приема звука, адаптивных методов обработки акустических сигналов, обработки информации в слухе человека и животных, проводятся исследования колебательных процессов в сложных механических структурах, изучаются акустико-гидродинамические явления, методы борьбы с шумами и вибрациями, разрабатываются технологии применения ультразвука.