Музей является структурным подразделением Первого МГМУ им. И.М. Сеченова и активно участвует в образовательном процессе. В его задачи входит проведение научно-исследовательской, собирательской, научно-фондовой и экскурсионной работы в целях сохранения и популяризации историко-культурного и научного наследия старейшего медицинского вуза России.